An der Spitze des Verkehrsverein Paderborn steht ein ehrenamtlicher Vorstand, der von der Mitgliederversammlung für jeweils drei Jahre (zuletzt 2025) gewählt wird. Ihm steht ein Beirat mit beratender Funktion zur Seite. 

Dem Vorstand gehören laut der Wahl in der Mitgliederversammlung 2022 an:

Heiko Appelbaum
Dietrich Honervogt (Vorsitzender)
Ralf Pahlsmeier
Uwe Seibel (stellv. Vorsitzender)
Christian Stork
Anja Veith 
sowie Bürgermeister Stefan-Oliver Strate als  "geborenes" Mitglied.

Den Beirat bilden: 

Jürgen Behlke
Anja Jürgens
Neele Rickers
Jochen Viehoff